RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 LRCH3Q96II8 777 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TSC22D3Q99576 134 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CFHR5Q9BXR6 569 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 HIPK3Q9H422 1215 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 AP4S1Q9Y587 144 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 E5RI56 91 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 STX16O14662 325 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 DENRO43583 198 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CHRM3P20309 590 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CAPN3P20807 821 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 IL2P60568 153 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RHOAP61586 193 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 GRM2Q14416 872 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 VEPH1Q14D04 833 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RBBP7Q16576 425 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ARPINQ7Z6K5 226 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SYVN1Q86TM6 617 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CPNE9Q8IYJ1 553 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 GALNT4Q8N4A0 578 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 FAM192AQ9GZU8 254 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 Q9H521 79 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PIDD1Q9HB75 910 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PCTPQ9UKL6 214 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CXCL10P02778 98 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 HK3P52790 923 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RHDQ02161 417 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RPS6KA2Q15349 733 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 MAP7D1Q3KQU3 841 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TXNDC11Q6PKC3 985 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ZNF783Q6ZMS7 281 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TTC16Q8NEE8 873 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 BHMTQ93088 406 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SLC22A12Q96S37 553 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 MAP10Q9P2G4 905 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RAB26Q9ULW5 256 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 NDUFAF1Q9Y375 327 aa19.08■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ENO4A6NNW6 628 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 IQCF5A8MTL0 148 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 H7C0S8 307 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 KLK8O60259 260 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 SNX2O60749 519 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 SOD2P04179 222 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 CTPS1P17812 591 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 TPGS2Q68CL5 300 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 UGT3A1Q6NUS8 523 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 GPSM1Q86YR5 675 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 MARVELD2Q8N4S9 558 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 ESAMQ96AP7 390 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 SLC45A3Q96JT2 553 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 FEM1AQ9BSK4 669 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 HGH1Q9BTY7 390 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 CD274Q9NZQ7 290 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 HSFX1Q9UBD0 423 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 VPS51Q9UID3 782 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 PKP3Q9Y446 797 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 ZNF711Q9Y462 761 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 AP4B1Q9Y6B7 739 aa19.08■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 PRRG1O14668 218 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 ANGPT2O15123 496 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 VPS4BO75351 444 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 PRAMEF12O95522 483 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 CSKP41240 450 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 CLCN4P51793 760 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 MFN1Q8IWA4 741 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 RIN3Q8TB24 985 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 WFDC5Q8TCV5 224 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 KCNJ9Q92806 393 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 HACD3Q9P035 362 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 STOML2Q9UJZ1 356 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 ZNF225Q9UK10 706 aa19.07■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 MATN4O95460 622 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 ESRRBO95718 433 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 CAPNS1P04632 268 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 IDO1P14902 403 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 CD9P21926 228 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 PTGER3P43115 390 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 DIO3P55073 304 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 SCIMPQ6UWF3 145 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa19.06■□□□□ 0.64
USP21-201ENST00000289865 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms