RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIA2P42262 883 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPN5P54829 565 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCT6BQ92526 530 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ITM2BQ9Y287 266 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN12O95859 305 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ESR1P03372 595 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF30P17039 623 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GM2AP17900 193 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TFEBP19484 476 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGALP20701 1170 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GRK2P25098 689 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP12P39900 470 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CLCN7P51798 805 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR33Q49SQ1 333 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NXPE1Q8N323 547 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TMIEQ8NEW7 156 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CD200R1Q8TD46 325 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PPM1EQ8WY54 764 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNJ9Q92806 393 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ARRDC3Q96B67 414 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 COL4A2P08572 1712 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CKAP5Q14008 2032 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PLK4O00444 970 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PRNPP04156 253 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GALK1P51570 392 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PFKPQ01813 784 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ENPP2Q13822 863 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 AAK1Q2M2I8 961 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPMQ5VYY2 423 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZVL8 140 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MTSS1LQ765P7 747 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DPPA4Q7L190 304 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SCAMP4Q969E2 229 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCG8Q9H221 673 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG9Q9H6U8 611 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 K7EQS6 105 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PFDN6O15212 129 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGB7P26010 798 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ETV3P41162 512 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCR10P46092 362 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 B4GALNT1Q00973 533 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF7Q14155 803 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4D1Q15615 310 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 FITM2Q8N6M3 262 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8D1Q8WZ84 308 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM161BQ96MY7 647 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NAGLUP54802 743 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPIQ6XZB0 460 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RBFAQ8N0V3 343 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 UCMAQ8WVF2 138 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CD207Q9UJ71 328 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MID2Q9UJV3 735 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MYO10Q9HD67 2058 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0G2JND7 137 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 H0YHG0 523 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHX1P07099 455 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RBP1P09455 135 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KITP10721 976 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MTHFD2P13995 350 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRM3P20309 590 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms