RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 COPS4Q9BT78 406 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 GBA3Q9H227 469 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CNTN3Q9P232 1028 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 OPTCQ9UBM4 332 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 DUX4Q9UBX2 424 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 C7orf72A4D263 438 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 MOXD2PA6NHM9 499 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 DPYSL2Q16555 572 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ZNF484Q5JVG2 852 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 Q6ZNX1 250 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SCML4Q8N228 414 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 LRRC20Q8TCA0 184 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 IRGQQ8WZA9 623 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SERHL2Q9H4I8 314 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SERHLQ9NQF3 203 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 MOCS1Q9NZB8 636 aa15□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 PRR23AA6NEV1 266 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 EDIL3O43854 480 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CDC42P60953 191 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 LILRA2Q8N149 483 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 BIRC7Q96CA5 298 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 B4GAT1O43505 415 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 RECQL4O94761 1208 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SNX4O95219 450 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SMIM18P0DKX4 95 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 OLR1P78380 273 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SCN1BQ07699 218 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ACAP2Q15057 778 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ZNF404Q494X3 552 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 NCSTNQ92542 709 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 FEM1CQ96JP0 617 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 LRRC3Q9BY71 257 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 RIPK3Q9Y572 518 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 H0YJX3 145 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 RAMP2O60895 175 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 C8BP07358 591 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 MYL12AP19105 171 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 PTPN9P43378 593 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CHRNA4P43681 627 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SLC15A1P46059 708 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 POLD2P49005 469 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 BLVRAP53004 296 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 TSSK3Q96PN8 268 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SORT1Q99523 831 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 GMIPQ9P107 970 aa14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.98□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.98□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CTSKP43235 329 aa14.98□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 ALDH3A2P51648 485 aa14.98□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 CYP4F8P98187 520 aa14.98□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 LCP2Q13094 533 aa14.98□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.98□□□□□ -0.01
CASC3-201ENST00000264645 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms