RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rag1P15919 1040 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HmgclP38060 325 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ClgnP52194 611 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pon1P52430 355 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pdx1P52946 284 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PhbP67778 272 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cdkl4Q3TZA2 342 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nfatc2Q60591 927 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sim2Q61079 657 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CpmQ80V42 443 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgef38Q80VK6 770 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stkld1Q80YS9 662 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf770Q8BIQ8 705 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Epc1Q8C9X6 813 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nipal2Q91WC7 383 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dydc1Q9D9T0 175 aa18.51■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Itpripl1A2ASA8 547 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gbp11A9YVJ5 442 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adamts14E9PX39 1209 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dusp8O09112 663 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ifnar2O35664 513 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Drc1Q3USS3 753 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmtc4Q8BG19 741 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sema3dQ8BH34 777 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rfx6Q8C7R7 927 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hectd2Q8CDU6 774 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ift43Q9DA69 206 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dgat2Q9DCV3 388 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dgcr8Q9EQM6 773 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 UxtQ9WTZ0 157 aa18.5■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ttll11A4Q9F4 727 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sod3O09164 251 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lingo4Q149C3 593 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hk3Q3TRM8 922 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc8bQ5DU41 803 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Armc5Q5EBP3 926 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ScinQ60604 715 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prr18Q6PAN7 307 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nmur2Q8BZ39 395 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc24a5Q8C261 501 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fcho1Q8K285 873 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcdha5Q91Y15 934 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lcn9Q9D267 178 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dusp21Q9D9D8 189 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Angptl2Q9R045 493 aa18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ttll9A2APC3 461 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mup18A2BIM8 181 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif6E9PX57 802 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr611K7N609 323 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr612L7N462 323 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MaffO54791 156 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Klc2O88448 599 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mup11P04938 181 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HccsP53702 272 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc12a2P55012 1205 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CtscP97821 462 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam98aQ3TJZ6 515 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hbq1bQ3U0A6 142 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm21320Q4FZE8 181 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adam2Q60718 735 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MelkQ61846 643 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fastkd1Q6DI86 829 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spag5Q7TME2 1165 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Chil6Q80W26 440 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nat14Q8BVG8 206 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Npsr1Q8BZP8 371 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Impa2Q91UZ5 290 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Creb3l4Q9D2A5 370 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prl8a6Q9DAY2 240 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gpatch1Q9DBM1 930 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pkmyt1Q9ESG9 490 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tacc3Q9JJ11 631 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 RgrQ9Z2B3 291 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atg2bQ80XK6 2075 aa18.48■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bfsp1A2AMT1 669 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CerklA2AQH1 525 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MipepA6H611 711 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 E9Q0B3 247 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 LipiF6YQT7 476 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scamp3O35609 349 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 RxraP28700 467 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rack1P68040 317 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sox4Q06831 440 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Snx21Q3UR97 363 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Defb28Q3V2L0 89 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf532Q6NXK2 1036 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc1Q80VQ1 524 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 B3gnt5Q8BGY6 376 aa18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms