RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 PGBD5Q8N414 524 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HIPK4Q8NE63 616 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ADCY4Q8NFM4 1077 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RAET1EQ8TD07 263 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.945e-11■■■■■ 94.1
EFTUD2-222ENST00000592408 ROPN1LQ96C74 230 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ASB9Q96DX5 294 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 C19orf60Q96EN9 201 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PSKH2Q96QS6 385 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 MARCH5Q9NX47 278 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GVM2 712 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ILVBLA1L0T0 632 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 DPPA5A6NC42 116 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM233B4DJY2 109 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BNX3 289 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 MRASO14807 208 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GIPC1O14908 333 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 AURKAO14965 403 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 INSIG1O15503 277 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CFLARO15519 480 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS26AO75436 327 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RHOBTB1O94844 696 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 LATS1O95835 1130 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CHEK2O96017 543 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC4A1P02730 911 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 LYNP07948 512 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GFAPP14136 432 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX2P28328 305 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC25CP30307 473 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ACVRL1P37023 503 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ALDH1A3P47895 512 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP3CCP48454 512 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TTPAP49638 278 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 THOP1P52888 689 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CDKN2DP55273 166 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PSME3P61289 254 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 LCP2Q13094 533 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX6Q13608 980 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRE1Q14246 886 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GALNT3Q14435 633 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 COL19A1Q14993 1142 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 VEPH1Q14D04 833 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HECTD3Q5T447 861 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR158Q5T848 1215 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RASIP1Q5U651 963 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM198Q66K66 360 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 REP15Q6BDI9 236 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 STK40Q8N2I9 435 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 UCMAQ8WVF2 138 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GATA6Q92908 595 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RMDN1Q96DB5 314 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CASD1Q96PB1 797 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIB3Q96RU7 358 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 TSC22D3Q99576 134 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 DERL2Q9GZP9 239 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CWH43Q9H720 699 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 ADA2Q9NZK5 511 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 KLF15Q9UIH9 416 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 SARDHQ9UL12 918 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB26Q9ULW5 256 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF112Q9ULX5 631 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-222ENST00000592408 LCHNA4D1U4 455 aa9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms