RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 RAB26Q9ULW5 256 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 URADA6NGE7 173 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 REP15Q6BDI9 236 aa21.27■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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PTPRM-211ENST00000580170 TIMM22Q9Y584 194 aa21.24■□□□□ 0.99
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PTPRM-211ENST00000580170 SEPHS1P49903 392 aa21.24■□□□□ 0.99
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