RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559873.5

USP3-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-216ENST00000559873 PHACTR1Q9C0D0 580 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 TSPYL1Q9H0U9 437 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ASB8Q9H765 288 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 IL26Q9NPH9 171 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 TMEM9BQ9NQ34 198 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 VPS18Q9P253 973 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SOX13Q9UN79 622 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 OR1A2Q9Y585 309 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa10.01□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 LRRK1Q38SD2 2015 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PI4KAP42356 2102 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 CCDC78A2IDD5 438 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 F8W8V4 182 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 K7ESM1 405 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 INPP4BO15327 924 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 RASGRP1O95267 797 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ASMTLO95671 621 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 TTC4O95801 387 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SOD1P00441 154 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 POLBP06746 335 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ZNF883P0CG24 379 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 NME1P15531 152 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PLTPP55058 493 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 IRX4P78413 519 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 GUCY2DQ02846 1103 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PPARDQ03181 441 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ACVR1Q04771 509 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 NFATC2Q13469 925 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 CUL1Q13616 776 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 CHRNA6Q15825 494 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 BBS9Q3SYG4 887 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 TCEAL6Q6IPX3 200 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ENPP7Q6UWV6 458 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 LAYNQ6UX15 382 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 RFLNAQ6ZTI6 216 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ASCL5Q7RTU5 278 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 MPP5Q8N3R9 675 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 OTUD6BQ8N6M0 293 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 DDHD1Q8NEL9 900 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 OR13J1Q8NGT2 312 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 OR6P1Q8NGX9 317 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ZNF398Q8TD17 642 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SEC14L1Q92503 715 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 TCEAL3Q969E4 200 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 DCUN1D1Q96GG9 259 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 AGAP2Q99490 1192 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SMOC1Q9H4F8 434 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 GAREM1Q9H706 876 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 RMI1Q9H9A7 625 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 CHRAC1Q9NRG0 131 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 DNAJC28Q9NX36 388 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 MOSPD1Q9UJG1 213 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 KCTD3Q9Y597 815 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SNX11Q9Y5W9 270 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SCN8AQ9UQD0 1980 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 KNL1Q8NG31 2342 aa10□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 VEGFDO43915 354 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 AVILO75366 819 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 USP1O94782 785 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 CSF2P04141 144 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 MSH3P20585 1137 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PSMA3P25788 255 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 AKT1P31749 480 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PLA2G5P39877 138 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 CRADDP78560 199 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SLC7A5Q01650 507 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PEX6Q13608 980 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 FZD2Q14332 565 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 PTPRCAPQ14761 206 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 HLA-BQ31612 363 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 TEX35Q5T0J7 233 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 DOK6Q6PKX4 331 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.99□□□□□ -0.81
USP3-216ENST00000559873 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms