RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 ZBTB16Q05516 673 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CDK18Q07002 472 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 DUSP6Q16828 381 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 GALNTL6Q49A17 601 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 Q5PR19 223 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 AAGABQ6PD74 315 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TSSK4Q6SA08 328 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PARM1Q6UWI2 310 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 RRAGAQ7L523 313 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SEPT8Q92599 483 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 DYNLL2Q96FJ2 89 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 NEUROD6Q96NK8 337 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ZPBPQ9BS86 351 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 MAGEH1Q9H213 219 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SH2D4AQ9H788 454 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SLC25A13Q9UJS0 675 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 IL16Q14005 1332 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 GAGE12JA6NER3 117 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 RSPH10B2B2RC85 870 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ACKR2O00590 384 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SPTLC2O15270 562 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CREB3O43889 395 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ZBED4O75132 1171 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 KRT38O76015 456 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CIAO1O76071 339 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 RSPH10BP0C881 870 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SERPINA4P29622 427 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 OAZ1P54368 228 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 RHAGQ02094 409 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 GABPAQ06546 454 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TFCP2Q12800 502 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TDGQ13569 410 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ERV3-1Q14264 604 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ZSCAN26Q16670 478 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TTC22Q5TAA0 569 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 MTFR2Q6P444 385 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ZSCAN30Q86W11 494 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC25Q86WR0 208 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SMC5Q8IY18 1101 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ARRDC3Q96B67 414 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 AGAP3Q96P47 875 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PIGSQ96S52 555 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ACAD9Q9H845 621 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 RNF146Q9NTX7 359 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 FBXO40Q9UH90 709 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PNMA2Q9UL42 364 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 DUSP12Q9UNI6 340 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 AKAP13Q12802 2813 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TENM4Q6N022 2769 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 NAV1Q8NEY1 1877 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CYP21A2P08686 494 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF286BP0CG31 522 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 T-ENOLP0DO92 83 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PAX3P23760 479 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 MLH1P40692 756 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 SNAP25P60880 206 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CBX1P83916 185 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PPP2R5BQ15173 497 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 PLK5Q496M5 336 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC38Q502W7 563 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-218ENST00000553309 LIN54Q6MZP7 749 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms