RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931		A6NCN8	305 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	MFSD11	O43934	449 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	CLDN7	O95471	211 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	ASMTL	O95671	621 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	CD48	P09326	243 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	SKIL	P12757	684 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF30	P17039	623 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	IL4R	P24394	825 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	SERPINB6	P35237	376 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	ITK	Q08881	620 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	IGFBP7	Q16270	282 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	NCSTN	Q92542	709 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	BTBD6	Q96KE9	485 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR24	Q96S15	920 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	ISCU	Q9H1K1	167 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNK6	Q9Y257	313 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	MED13	Q9UHV7	2174 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	STK17B	O94768	372 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	PRL	P01236	227 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	PYGL	P06737	847 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	MYBL1	P10243	752 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	ACP5	P13686	325 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	CASR	P41180	1078 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	MAPK9	P45984	424 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	EPHB1	P54762	984 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXK1	P85037	733 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	IYD	Q6PHW0	289 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	STARD8	Q92502	1023 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	MAML1	Q92585	1016 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF31	Q96EP0	1072 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM11	Q96F44	468 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS18	Q9P253	973 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL3	Q9UH77	587 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
LETMD1-231	ENST00000551931	SNX2	O60749	519 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	DLGAP3	O95886	979 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD18	Q0P651	414 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	GALNT2	Q10471	571 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT81	Q14533	505 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	CENPE	Q02224	2701 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	HLA-DQB2	P05538	268 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	F3	P13726	295 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF28	P17035	718 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	F8A1	P23610	371 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	STAT5A	P42229	794 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	SPINT3	P49223	89 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	ARSE	P51690	589 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	EPHA4	P54764	986 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	GFER	P55789	205 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	C16orf46	Q6P387	395 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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