RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 VOPP1Q96AW1 172 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KLHL29Q96CT2 875 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CLPBQ9H078 707 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CLDND1Q9NY35 253 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MID2Q9UJV3 735 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ITM2BQ9Y287 266 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LRRC14BA6NHZ5 514 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TARM1B6A8C7 271 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 UBXN8O00124 270 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CDC7O00311 574 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 BTN3A1O00481 513 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 VPS26AO75436 327 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RBP1P09455 135 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CISD3P0C7P0 127 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GFAPP14136 432 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CPA2P48052 419 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CSNK1DP48730 415 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GRIN2CQ14957 1233 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ACAP2Q15057 778 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CES5AQ6NT32 575 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PARM1Q6UWI2 310 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 VITQ6UXI7 678 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 Q6ZVL8 140 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FRS2Q8WU20 508 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MYADMQ96S97 322 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TCF12Q99081 682 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NUF2Q9BZD4 464 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 COG4Q9H9E3 785 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MARK1Q9P0L2 795 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SARDHQ9UL12 918 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 A8MT66 165 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 E9PBE3 544 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FCHO1O14526 889 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KLHL41O60662 606 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 IL1BP01584 269 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PYGLP06737 847 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CD1DP15813 335 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 IGFBP4P22692 258 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GDI1P31150 447 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SOX9P48436 509 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 BNIP1Q12981 228 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 DMC1Q14565 340 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 OR4D1Q15615 310 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ARMC3Q5W041 872 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 STK40Q8N2I9 435 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FAM161BQ96MY7 647 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ACOX2Q99424 681 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.36□□□□□ -1.07
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CS-215ENST00000549143 CEP44Q9C0F1 390 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 WWP1Q9H0M0 922 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 HPS4Q9NQG7 708 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GDE1Q9NZC3 331 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 IL36AQ9UHA7 158 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 APPL1Q9UKG1 709 aa8.36□□□□□ -1.07
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CS-215ENST00000549143 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SOBPA7XYQ1 873 aa8.36□□□□□ -1.07
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