RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUS1Q96E22 293 aa19.19■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 HEMGNQ9BXL5 484 aa19.19■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPIL1Q9Y3C6 166 aa19.19■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0J9YYE9 177 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 BTNL10A8MVZ5 291 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PJA2O43164 708 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRBC1P01850 177 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSHRP16473 764 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPARDQ03181 441 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF7Q14155 803 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ELOCQ15369 112 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALG11Q2TAA5 492 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC66Q68CR7 880 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q6ZVL8 140 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZFAND4Q86XD8 727 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 LPCAT1Q8NF37 534 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 EXD1Q8NHP7 514 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 LGR4Q9BXB1 951 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLPBQ9H078 707 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRN3Q9H3W5 708 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDH9Q9HC56 1237 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 HAUS2Q9NVX0 235 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD84Q9UIB8 345 aa19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A1W2PQM1 296 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 MACROD2A1Z1Q3 448 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 BLACEA4D250 179 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRID2IPA4D2P6 1211 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM202A6NGA9 273 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 WT1P19544 449 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 NFKBIAP25963 317 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 POLE2P56282 527 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PNCKQ6P2M8 343 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDELC2Q7Z4H8 507 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA1524Q8TCG1 905 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 DTD2Q96FN9 168 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 HERPUD2Q9BSE4 406 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC12A9Q9BXP2 914 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 RABGEF1Q9UJ41 708 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLGA6CA6NDK9 693 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLGA6BA6NDN3 693 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLGA6DP0CG33 693 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITIH1P19827 911 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPN3P26045 913 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 HTR1BP28222 390 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCR10P46092 362 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 NR2C2P49116 596 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 HK3P52790 923 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 SRP54P61011 504 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTSQ03393 145 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 AADACL2Q6P093 401 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFAF2Q8N183 169 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC57Q8N9N7 239 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 P3H4Q92791 437 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP7Q93009 1102 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDXPQ96GD0 296 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR92Q96MX6 357 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLQ9UEF7 1012 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa19.16■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 STMND1H3BQB6 276 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLDN7O95471 211 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM23P36406 574 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP1A2P50993 1020 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 GALNT3Q14435 633 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCSK7Q16549 785 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 QPCTQ16769 361 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 TEX44Q53QW1 395 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 NT5DC3Q86UY8 548 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 KYQ8NBH2 561 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA22Q8NHS9 363 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR1E3Q8WZA6 343 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 CATSPER2Q96P56 530 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRD8Q9H0E9 1235 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR26Q9H7D7 661 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 C10orf88Q9H8K7 445 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 FGF22Q9HCT0 170 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXJ2Q9P0K8 574 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIRPGQ9P1W8 387 aa19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 F5H423 210 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSMD11O00231 422 aa19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms