RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PELI3Q8N2H9 469 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 FBF1Q8TES7 1133 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 ULK4Q96C45 1275 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TCF12Q99081 682 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 AGAP2Q99490 1192 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TOR1BO14657 336 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 LILRB5O75023 590 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 HSD17B3P37058 310 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR1P46091 355 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 NAB1Q13506 487 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PMS2CLQ68D20 193 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 RAET1GQ6H3X3 334 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 GALNT7Q86SF2 657 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 CILP2Q8IUL8 1156 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 CDKL2Q92772 493 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 CYTH2Q99418 400 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TEX101Q9BY14 249 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFATQ9P243 1243 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA8TH3BQL2 631 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A9O60656 530 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A6P19224 532 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A1P22309 533 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A4P22310 534 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A3P35503 534 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A5P35504 534 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 IGFALSP35858 605 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TTPAP49638 278 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 INPP5AQ14642 412 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PLK5Q496M5 336 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 NXPE1Q8N323 547 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 GLYATL1Q969I3 302 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 PRRX2Q99811 253 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A7Q9HAW7 530 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A10Q9HAW8 530 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UGT1A8Q9HAW9 530 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 FPGTO14772 594 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 NUDT17P0C025 328 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEFF1Q8IYR6 380 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 DDHD1Q8NEL9 900 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 COX14Q96I36 57 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 SERAC1Q96JX3 654 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC1Q99614 292 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 FETUBQ9UGM5 382 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-205ENST00000528462 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR39O43194 453 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 PCCBP05166 539 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 ACRV1P26436 265 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 PFN3P60673 137 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC6Q86X45 466 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 BMFQ96LC9 184 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR26Q9H7D7 661 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 FZD3Q9NPG1 666 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-205ENST00000528462 POM121BA6NF01 834 aa21.82■■□□□ 1.08
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