RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNK6Q9Y257 313 aa6.53□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2AG2A6NM03 316 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 C2orf81A6NN90 581 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 A6NNZ2 444 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ANXA9O76027 345 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 CDK14O94921 469 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ACP5P13686 325 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 TGM2P21980 687 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPN3P26045 913 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ARSEP51690 589 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC38Q5VT99 294 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 CES3Q6UWW8 571 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 HOOK3Q86VS8 718 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 LUZP4Q9P127 313 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 FZD4Q9ULV1 537 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.52□□□□□ -1.36
RRN3P1-201ENST00000514813 PJA2O43164 708 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 LILRA1O75019 489 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 CES1P23141 567 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 NR2C2P49116 596 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 GEMP55040 296 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 GALNT2Q10471 571 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 SEMA3BQ13214 749 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 PLCL1Q15111 1095 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 PGBD5Q8N414 524 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB7BQ96AH8 199 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2AG1Q9H205 316 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 RDH14Q9HBH5 336 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 A8MU76 341 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 CD160O95971 181 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 KELP23276 732 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGAP8P85298 464 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 IRF4Q15306 451 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 BBS12Q6ZW61 710 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 CNTD1Q8N815 330 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 DPH5Q9H2P9 285 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 ASB8Q9H765 288 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 EBF2Q9HAK2 575 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 K7ESM1 405 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 TCEA3O75764 348 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 PGLSO95336 258 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV4-34P06331 123 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 SERPINB3P29508 390 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 BLKP51451 505 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 TAS2R38P59533 333 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 INAVAQ3KP66 663 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 LIPIQ6XZB0 460 aa6.51□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms