RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 USP30Q70CQ3 517 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 TTC7BQ86TV6 843 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PALM2Q8IXS6 379 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 MREGQ8N565 214 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CDKL2Q92772 493 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CLDN23Q96B33 292 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 SCRN2Q96FV2 425 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CFAP36Q96G28 342 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 GPR63Q9BZJ6 419 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 VCANP13611 3396 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 MYLKQ15746 1914 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 DYNC1I1O14576 645 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 AP1G1O43747 822 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF217O75362 1048 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 AVILO75366 819 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PRLP01236 227 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PDHA1P08559 390 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ABHD2P08910 425 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CTPS1P17812 591 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 HMGCLP35914 325 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 P2RY2P41231 377 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ELK3P41970 407 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 GRIA1P42261 906 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 FAM193AP78312 1265 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PRAMEP78395 509 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CRYMQ14894 314 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC66Q68CR7 880 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 DPPA4Q7L190 304 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 STYXQ8WUJ0 223 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 HMGB4Q8WW32 186 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 RUFY1Q96T51 708 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 KIFC1Q9BW19 673 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CDH19Q9H159 772 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CAPN10Q9HC96 672 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 SARDHQ9UL12 918 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 FAM229AH3BQW9 127 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 PFDN6O15212 129 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 TSPAN6O43657 245 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ACSL3O95573 720 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ALPIP09923 528 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 TPH1P17752 444 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 AOC1P19801 751 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 OXTRP30559 389 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 HNF1BP35680 557 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CRADDP78560 199 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 CNTN1Q12860 1018 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 MTM1Q13496 603 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 NAB1Q13506 487 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 IHHQ14623 411 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 LONRF1Q17RB8 773 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.69□□□□□ -0.86
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