RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	EPHA5	P54756	1037 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	NAGLU	P54802	743 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	GNA12	Q03113	381 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ZP2	Q05996	745 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	BTK	Q06187	659 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNI	Q14094	377 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CSHL1	Q14406	222 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	UNC50	Q53HI1	259 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	FSCB	Q5H9T9	825 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	LIPM	Q5VYY2	423 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	DENND1C	Q8IV53	801 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	LEMD2	Q8NC56	503 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	FGF14	Q92915	247 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	VOPP1	Q96AW1	172 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	PTER	Q96BW5	349 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	FEM1C	Q96JP0	617 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MARK4	Q96L34	752 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	RILP	Q96NA2	401 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	GCNA	Q96QF7	691 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC22A12	Q96S37	553 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC30A3	Q99726	388 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	THTPA	Q9BU02	230 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNK12	Q9HB15	430 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	GDE1	Q9NZC3	331 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ACOT9	Q9Y305	439 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		5.8	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A087X1B8	175 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GTL3	188 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730		H3BMM5	538 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	AP3B1	O00203	1094 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP6C	O00743	305 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	NEMP1	O14524	444 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	INSIG1	O15503	277 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC7A4	O43246	635 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	SPINT1	O43278	529 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	OIP5	O43482	229 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	DCX	O43602	365 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	KDELR3	O43731	214 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT34	O76011	436 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE5A	O76074	875 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	COL6A2	P12110	1019 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	STMN1	P16949	149 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPAN8	P19075	237 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TFEB	P19484	476 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	PIK3R1	P27986	724 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	EPHA3	P29320	983 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CRABP2	P29373	138 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1E1	P30953	314 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	HADHA	P40939	763 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP3CC	P48454	512 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	POLD2	P49005	469 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MAPKAPK2	P49137	400 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CLCN5	P51795	746 aa		5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ARF5	P84085	180 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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