RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMD13Q9UNM6 376 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPQQ9Y646 472 aa15.46■□□□□ 0.07
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL4A6Q14031 1691 aa15.46■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMD3O43242 534 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CKMP06732 381 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FMO4P31512 558 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIGGQ5H8A4 983 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARPINQ7Z6K5 226 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUN2Q9UH99 717 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS28Q9UK41 221 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPEGQ15772 3267 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PRU2 124 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WASH4PA8MWX3 477 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E7ENX8 843 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINF2P08697 491 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGB6P18564 788 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABRR2P28476 465 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRDX6P30041 224 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HADHAP40939 763 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APCDD1Q8J025 514 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOLKQ9UPQ8 538 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAT1P18440 290 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARF5P84085 180 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL23RQ5VWK5 629 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF558Q96NG5 402 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDFQ9HBH1 243 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VTI1BQ9UEU0 232 aa15.45■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBDO15205 165 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 S1PR4O95977 384 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOD2P04179 222 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSME3P61289 254 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF19Q2TAC6 998 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLC3Q6P597 504 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC80Q76M96 950 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBAP1Q9NZ09 502 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM247A6NEH6 219 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP3B1O00203 1094 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXA2O43364 376 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXCL10P02778 98 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 URODP06132 367 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL6A1P12109 1028 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFKBIAP25963 317 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYTH1Q15438 398 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARP15Q460N3 678 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMIGO2Q86SJ2 522 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOP1MTQ969P6 601 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.44■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM24O15164 1050 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCL16O15467 120 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFPL2O75678 378 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD160O95971 181 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNPP09543 421 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSKP41240 450 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAREM2Q75VX8 874 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDI1Q8WTU0 396 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTERQ96BW5 349 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC30A3Q99726 388 aa15.43■□□□□ 0.06
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM175Q9BSA9 504 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms