RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 PGGT1BP53609 377 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MYBPHQ13203 477 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CRYMQ14894 314 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 AMZ1Q400G9 498 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RILPL1Q5EBL4 403 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 XKR9Q5GH70 373 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SARM1Q6SZW1 724 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 DSELQ8IZU8 1212 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ZNF114Q8NC26 417 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 APBB2Q92870 758 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CALML4Q96GE6 196 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MTMR6Q9Y217 621 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.25□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OR2A25A4D2G3 310 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 M0QZ24 198 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ADAMDEC1O15204 470 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MID1O15344 667 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OGG1O15527 345 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ADAM20O43506 726 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HS6ST1O60243 411 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KCNJ13O60928 360 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 BEST1O76090 585 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ADRB2P07550 413 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MMP9P14780 707 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CD58P19256 250 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PON1P27169 355 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 BDKRB2P30411 391 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 STX2P32856 288 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 MFAP4P55083 255 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ZXDBP98169 803 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ECT2LQ008S8 904 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CHAF1BQ13112 559 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 BECN1Q14457 450 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PCLAFQ15004 111 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PLCB4Q15147 1175 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NAB2Q15742 525 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KRT24Q2M2I5 525 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ZNF805Q5CZA5 627 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RHBDF2Q6PJF5 856 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KBTBD6Q86V97 674 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OR5R1Q8NH85 324 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HM13Q8TCT9 377 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SLC44A1Q8WWI5 657 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 POMGNT1Q8WZA1 660 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 OTULINQ96BN8 352 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 DOCK7Q96N67 2140 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 ABHD1Q96SE0 405 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 PAFAH2Q99487 392 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 GFI1Q99684 422 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 KXD1Q9BQD3 176 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 LRRC4Q9HBW1 653 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CLIC5Q9NZA1 410 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NRBP1Q9UHY1 535 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CMAHPQ9Y471 501 aa3.24□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 A0A0U1RQJ8 604 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CDRT15L2A8MXV6 281 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CTDSP2O14595 271 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CAMTA2O94983 1202 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NGFRP08138 427 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 HOXC6P09630 235 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 SLC15A1P46059 708 aa3.23□□□□□ -1.89
SENP6-208ENST00000483859 NRIP1P48552 1158 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms