RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TXNDC9O14530 226 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 HRO43593 1189 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TLR5O60602 858 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CRCPO75575 148 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CNTN5O94779 1100 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RHOBTB1O94844 696 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CDK14O94921 469 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ARHGEF15O94989 841 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ESRRBO95718 433 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ESR1P03372 595 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ITGB1P05556 798 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 GFAPP14136 432 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CSF2RAP15509 400 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 SYN1P17600 705 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PSMC3P17980 439 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MSH3P20585 1137 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CDC25CP30307 473 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CDKN2DP55273 166 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 IL2P60568 153 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MS4A2Q01362 244 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CLCQ05315 142 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ZNF460Q14592 562 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 KIF19Q2TAC6 998 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MTX3Q5HYI7 312 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 HECTD3Q5T447 861 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RNF220Q5VTB9 566 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TMEM198Q66K66 360 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TPGS2Q68CL5 300 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PROSER1Q86XN7 944 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 LGI2Q8N0V4 545 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 HIPK4Q8NE63 616 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 OR2T3Q8NH03 318 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 HM13Q8TCT9 377 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 HASPINQ8TF76 798 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 LPGAT1Q92604 370 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 KCNJ9Q92806 393 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PHF21BQ96EK2 531 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 SGF29Q96ES7 293 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 NDNQ99608 321 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 NPAS2Q99743 824 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CD320Q9NPF0 282 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RNF112Q9ULX5 631 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 A0A0J9YYE9 177 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PP18 115 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 CAPN8A6NHC0 703 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 E7ENX8 843 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 ENPP3O14638 875 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 SNX2O60749 519 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 CR2P20023 1033 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 ITGB8P26012 769 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 GSTT1P30711 240 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 TTKP33981 857 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 GMPRP36959 345 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 ARSDP51689 593 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 KCNK10P57789 538 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 MAXP61244 160 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 IKBKEQ14164 716 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 GEN1Q17RS7 908 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-208ENST00000464611 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.46□□□□□ -1.06
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