RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 LDB2O43679 373 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 BANF1O75531 89 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CRTAMO95727 393 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MLNP12872 115 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF30P17039 623 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ITPKAP23677 461 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ADRA1DP25100 572 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PLTPP55058 493 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CALCOCO2Q13137 446 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ELF2Q15723 593 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 BBS9Q3SYG4 887 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ALS2CLQ60I27 953 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 Q6ZVL8 140 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 C11orf74Q86VG3 221 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HOOK3Q86VS8 718 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PELI3Q8N2H9 469 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4K2Q8NGD2 314 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 OR13C4Q8NGS5 318 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IFT81Q8WYA0 676 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ART4Q93070 314 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SCAMP4Q969E2 229 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NUS1Q96E22 293 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCG8Q9H221 673 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TRABDQ9H4I3 376 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SYBUQ9NX95 663 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IL17CQ9P0M4 197 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HEATR9A2RTY3 570 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 C2orf81A6NN90 581 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 AP3B1O00203 1094 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PCCBP05166 539 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIP17213 487 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CD27P26842 260 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IGFALSP35858 605 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HMGCLP35914 325 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SPINT3P49223 89 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL4CP56559 192 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDN2P57739 230 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC14Q15048 493 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IRF4Q15306 451 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PCID2Q5JVF3 399 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CASC4Q6P4E1 433 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CES3Q6UWW8 571 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SYT9Q86SS6 491 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR26Q8NDV2 337 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ASB12Q8WXK4 309 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SEC14L1Q92503 715 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PIGKQ92643 395 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CENPTQ96BT3 561 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DTD2Q96FN9 168 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SERAC1Q96JX3 654 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF778Q96MU6 729 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC6A18Q96N87 628 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 AGAP2Q99490 1192 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC30A3Q99726 388 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PKP3Q9Y446 797 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms