RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 TKTL2Q9H0I9 626 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 WDCPQ9H6R7 721 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 KBTBD4Q9NVX7 518 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 OGFRQ9NZT2 677 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TSPAN11A1L157 253 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GOLGA6CA6NDK9 693 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GOLGA6BA6NDN3 693 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 HAX1O00165 279 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GOLGA6DP0CG33 693 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 FOLR1P15328 257 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GTF2H1P32780 548 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 MXI1P50539 228 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 DGKQP52824 942 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SOX8P57073 446 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 RHOAP61586 193 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TAF5Q15542 800 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM270Q6UE05 265 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 FAM92BQ6ZTR7 304 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 NUS1Q96E22 293 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZDHHC12Q96GR4 267 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SEC14L3Q9UDX4 400 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PADI2Q9Y2J8 665 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 MEN1O00255 615 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PDXKO00764 312 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 INSIG1O15503 277 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TMCC1O94876 653 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 RALGDSQ12967 914 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 KCNAB1Q14722 419 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GRM3Q14832 879 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PYCR3Q53H96 274 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 LCN10Q6JVE6 187 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GALNT13Q8IUC8 556 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZSWIM1Q9BR11 485 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 EPS8L2Q9H6S3 715 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CUBNO60494 3623 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0G2JNG1 304 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 E5RJQ4 531 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 KIR2DS3K7RE56 304 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 BUB1O43683 1085 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 GPD2P43304 727 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ARL4DP49703 201 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ENPEPQ07075 957 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 KIR2DS5Q14953 304 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 IRGCQ6NXR0 463 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 DSELQ8IZU8 1212 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 PAF1Q8N7H5 531 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf74Q96LT6 269 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 LRFN5Q96NI6 719 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 AGAP4Q96P64 663 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CUEDC2Q9H467 287 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 TBC1D29Q9UFV1 150 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC78A2IDD5 438 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 TLCD2A6NGC4 264 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 OR5K4A6NMS3 321 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 SNX2O60749 519 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 SLC19A2O60779 497 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 GLI1P08151 1106 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 EBLN1P0CF75 366 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 GM2AP17900 193 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 MARSP56192 900 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 C3AR1Q16581 482 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 AFMIDQ63HM1 303 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 RAET1GQ6H3X3 334 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF354CQ86Y25 554 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 SLC38A9Q8NBW4 561 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-211ENST00000463372 ACRBPQ8NEB7 543 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms