RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 CFAP99D6REC4 459 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 F8W8V4 182 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 AURKAO14965 403 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZNF185O15231 689 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 YY2O15391 372 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 VEGFDO43915 354 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PHF2O75151 1096 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CDK14O94921 469 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ECEL1O95672 775 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 BPIP17213 487 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ITGALP20701 1170 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 POLD2P49005 469 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 DCDC1P59894 354 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 E2F1Q01094 437 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SHBQ15464 509 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CASC4Q6P4E1 433 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TRIM74Q86UV6 250 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PRELID2Q8N945 189 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GPR26Q8NDV2 337 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZNF398Q8TD17 642 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZNF592Q92610 1267 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GLYATL1Q969I3 302 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 RTP4Q96DX8 246 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OR2M4Q96R27 311 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ZMYND15Q9H091 742 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OR2AG1Q9H205 316 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ASB8Q9H765 288 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SUFUQ9UMX1 484 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CEP250Q9BV73 2442 aa9.5□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CFAP54Q96N23 3096 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 HEATR9A2RTY3 570 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 B4DGG1 531 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TRIM38O00635 465 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GRID2O43424 1007 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SNX2O60749 519 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CEACAM5P06731 702 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 IVLP07476 585 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 FTH1P19P0C7X4 201 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SLC2A4P14672 509 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 JUPP14923 745 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 GM2AP17900 193 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ADRA1AP35348 466 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 NPY2RP49146 381 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 FNTAP49354 379 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PRAMEP78395 509 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CDK16Q00536 496 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ILKQ13418 452 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OLIG2Q13516 323 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SEMA5AQ13591 1074 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CHRNA6Q15825 494 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CDKN3Q16667 212 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 INSCQ1MX18 579 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PCGF5Q86SE9 256 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 STYXQ8WUJ0 223 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 NAT6Q93015 286 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ULK4Q96C45 1275 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 PDXPQ96GD0 296 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 APOLD1Q96LR9 279 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 WDR24Q96S15 920 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 AGAP2Q99490 1192 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 LRRC61Q9BV99 259 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PKP4-208ENST00000462335 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms