RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C12orf29Q8N999 325 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITFG1Q8TB96 612 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF125Q96EQ8 232 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PKMYT1Q99640 499 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANO10Q9NW15 660 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP72Q9P209 647 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STX10O60499 249 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TACC1O75410 805 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SUN1O94901 812 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CER1O95813 267 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNA14O95837 355 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSF1P09603 554 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEBPBP17676 345 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATF6P18850 670 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRM1P23921 792 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADORA2BP29275 332 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NTSR1P30989 418 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UQCRC1P31930 480 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCR2P41597 374 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNC1P48547 511 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LHX1P48742 406 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITIH3Q06033 890 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLD1Q13393 1074 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FHL3Q13643 280 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERV3-1Q14264 604 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ICE2Q659A1 982 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPGS2Q68CL5 300 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYT12Q8IV01 421 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCED1BQ96HM7 432 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYADMQ96S97 322 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACBD6Q9BR61 282 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THAP9Q9H5L6 903 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCNT4Q9P109 453 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDH9Q9ULB4 789 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCTD3Q9Y597 815 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOTCH4Q99466 2003 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM170AA1A519 330 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOR1BO14657 336 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLUHO75153 1309 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHOP08100 348 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MED14OSP0DP75 135 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P4HA1P13674 534 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCD3P28288 659 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPHA3P29320 983 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTHFRP42898 656 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLD2P49005 469 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLK7P49862 253 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENPEPQ07075 957 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALNT2Q10471 571 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CUL2Q13617 745 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRM7Q14831 915 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLCA4Q14CN2 919 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR68Q15743 365 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIIPQ5JXC2 388 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METRNLQ641Q3 311 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM171BQ6P995 826 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms