RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443634.1

SNRPBP1-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SNRPBP1, Length 282 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP1-201ENST00000443634 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.7□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.7□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 OR1A2Q9Y585 309 aa6.7□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.7□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 FAM186AA6NE01 2351 aa6.7□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.7□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 NUMA1Q14980 2115 aa6.7□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 KMOO15229 486 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 SPINT1O43278 529 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CDK14O94921 469 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 WNT1P04628 370 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 POLBP06746 335 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 C1SP09871 688 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 BPIP17213 487 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 GNPDA1P46926 289 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 ID4P47928 161 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 HK3P52790 923 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TMPRSS15P98073 1019 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CACNG1Q06432 222 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 PTK6Q13882 451 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 LRP8Q14114 963 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 FZD2Q14332 565 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 MORF4L2Q15014 288 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 KCTD11Q693B1 232 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 C8orf74Q6P047 294 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 SNX20Q7Z614 316 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 NAXDQ8IW45 347 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 GPR26Q8NDV2 337 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CALML6Q8TD86 181 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 RANBP9Q96S59 729 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 COPS8Q99627 209 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 ABCG4Q9H172 646 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CASS4Q9NQ75 786 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 VPS18Q9P253 973 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 ARL5AQ9Y689 179 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.69□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 PRSS38A1L453 326 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 OR5K4A6NMS3 321 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TPP1O14773 563 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 SCAMP1O15126 338 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 GRID2O43424 1007 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TNFSF14O43557 240 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 KDM1AO60341 852 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 GDF9O60383 454 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 NDUFS3O75489 264 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 PIAS2O75928 621 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 PRAMEF1O95521 474 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TTC4O95801 387 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 IVLP07476 585 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 GSTM1P09488 218 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CEACAM1P13688 526 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 DGKAP23743 735 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 MC4RP32245 332 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 HALP42357 657 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 E2F1Q01094 437 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 GSTM4Q03013 218 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 KRT33BQ14525 404 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CHRNA6Q15825 494 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CDKN3Q16667 212 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 INSCQ1MX18 579 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNRPBP1-201ENST00000443634 TTC27Q6P3X3 843 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms