RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 DEF6Q9H4E7 631 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 PDP2Q9P2J9 529 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 INPP4BO15327 924 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 MTA2O94776 668 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CD86P42081 329 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 SLC14A2Q15849 920 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 AGBL5Q8NDL9 886 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 TAAR9Q96RI9 348 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 DDA1Q9BW61 102 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 BSNQ9UPA5 3926 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 B8ZZF3 427 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 STMND1H3BQB6 276 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK1O00180 336 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CBFA2T2O43439 604 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ASMTLO95671 621 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 JCHAINP01591 159 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CCL4P13236 92 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 DCDC1P59894 354 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB17Q13105 803 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 MESDQ14696 234 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC38Q5VT99 294 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 OLFM3Q96PB7 478 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 TRIB3Q96RU7 358 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CARD9Q9H257 536 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 LRRD1A4D1F6 860 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 A6NCN8 305 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 DUX1O43812 170 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 AKR1B10O60218 316 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 GPR89BP0CG08 455 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A4P14672 509 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ARSDP51689 593 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 TADA1Q96BN2 335 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A3Q99624 504 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 B4E171 279 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 APOL1O14791 398 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 NUAK1O60285 661 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 EML2O95834 649 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.924e-7■■□□□ 14.4
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN7P41732 249 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CLCNKAP51800 687 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 HHEXQ03014 270 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 PDK1Q15118 436 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 AVL9Q8NBF6 648 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 OR10G6Q8NH81 332 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 RAD18Q9NS91 495 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 SDK2Q58EX2 2172 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.77■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JNG1 304 aa20.77■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 J3QKU1 62 aa20.77■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.77■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 AGRPO00253 132 aa20.77■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 EPHA4P54764 986 aa20.77■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 RAB15P59190 212 aa20.77■□□□□ 0.92
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