RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKP3Q9Y446 797 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYCE1LA8MT33 242 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3BNX3 289 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AZIN1O14977 448 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LILRB3O75022 631 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAG1P15918 1043 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMGCLP35914 325 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXA1P55317 472 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XIAPP98170 497 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STX5Q13190 355 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGKQ53H12 422 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KANK2Q63ZY3 851 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD200R1Q8TD46 325 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNJ9Q92806 393 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EID2BQ96D98 161 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO19Q96H55 970 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEE1Q9HCI5 957 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC167Q9P0B6 97 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTN3A1O00481 513 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR39O43194 453 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGLSO95336 258 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CKMP06732 381 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTPS1P17812 591 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADARP55265 1226 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLCQ05315 142 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCP2Q13094 533 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FLOT2Q14254 428 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GEN1Q17RS7 908 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMC12Q5T9G4 340 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RETSATQ6NUM9 610 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRGCQ6NXR0 463 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6K2Q8NGY2 324 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDI1Q8WTU0 396 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR63Q9BZJ6 419 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB3Q9Y575 518 aa18.59■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS17P08708 135 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALPIP09923 528 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTGER3P43115 390 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP4BP51164 291 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLC1Q07866 573 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC16Q13042 620 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R42Q7RTR8 314 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF148Q8N7C7 305 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIH1D2Q8WWB5 315 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ECSITQ9BQ95 431 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKTIPQ9H8T0 292 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COMMD10Q9Y6G5 202 aa18.58■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARNS1A5YM72 827 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBP2O00757 339 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIP5K1BO14986 540 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGM5O43548 720 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLK8O60259 260 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ESR1P03372 595 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSF2RAP15509 400 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ME2P23368 584 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGB8P26012 769 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPM1AP35813 382 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL2P60568 153 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACNG1Q06432 222 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX31Q8N9S9 440 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNA7Q96RP8 456 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa18.58■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GTL3 188 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E5RI56 91 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STX16O14662 325 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRM3P20309 590 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CA8P35219 290 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRP8Q14114 963 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMEL1Q495T6 779 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKS6Q68DC2 871 aa18.57■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REP15Q6BDI9 236 aa18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms