RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 53.6
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKD2Q9BZL6 878 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 VWA7Q9Y334 891 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ANGPT2O15123 496 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 INPP4BO15327 924 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SOX11P35716 441 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CLCNKBP51801 687 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXA1P55317 472 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PURAQ00577 322 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CD300CQ08708 224 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GEN1Q17RS7 908 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PTERQ96BW5 349 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MPP6Q9NZW5 540 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PSME2Q9UL46 239 aa18.26■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 OR51F1A6NGY5 319 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC14BA6NHZ5 514 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 B4GAT1O43505 415 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PAGE1O75459 146 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GRB7Q14451 532 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CILP2Q8IUL8 1156 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CSF3RQ99062 836 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 HEPHQ9BQS7 1158 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GABRQQ9UN88 632 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TCRBV5S2A0A599 114 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 E2F6O75461 281 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 BDNFP23560 247 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ELK4P28324 431 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 LHX1P48742 406 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MAXP61244 160 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC14A2Q15849 920 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CALML6Q8TD86 181 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB2BQ8WUD1 216 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC58Q96CX6 371 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNA7Q96RP8 456 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMOQ9BU70 441 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TMED5Q9Y3A6 229 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.25■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 C17orf102A2RUQ5 167 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KRBA1A5PL33 1030 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PIP5K1BO14986 540 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNH1O95259 989 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A1P02730 911 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 JAK1P23458 1154 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ARSDP51689 593 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 HERVK_113P63132 956 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CAP1Q01518 475 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM32Q13049 653 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 IRF5Q13568 498 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBA3CQ13748 450 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM16LQ309B1 348 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TBPL2Q6SJ96 375 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MIER2Q8N344 545 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MYLPFQ96A32 169 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TAMM41Q96BW9 452 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 L3HYPDHQ96EM0 354 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MID1IP1Q9NPA3 183 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF639Q9UID6 485 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 DYTNA2CJ06 578 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 H0Y858 1186 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 H0YAE9 185 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK14O94921 469 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 BROXQ5VW32 411 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 XAF1Q6GPH4 301 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNEQ86WN2 208 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 CLYBLQ8N0X4 340 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SFRP1Q8N474 314 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN18Q96SJ8 248 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 LHPPQ9H008 270 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 TLR9Q9NR96 1032 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 GIN1Q9NXP7 522 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.24■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
RALGPS1-208ENST00000424082 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms