RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS18Q9P253 973 aa13.06□□□□□ -0.32
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKAB1Q9Y478 270 aa13.05□□□□□ -0.32
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD11O43934 449 aa13.04□□□□□ -0.32
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MC1RQ01726 317 aa13.04□□□□□ -0.32
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IHHQ14623 411 aa13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13.04□□□□□ -0.32
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISCUQ9H1K1 167 aa13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPB41L1Q9H4G0 881 aa13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RMI1Q9H9A7 625 aa13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHKBQ9Y259 395 aa13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL3Q9Y4R7 772 aa13.04□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBASA2RRP1 2371 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JNG1 304 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC18AA5D8T8 446 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LILRA5A6NI73 299 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FADS2P1A8MWK0 482 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DS3K7RE56 304 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX2O60749 519 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRLP01236 227 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD34CP0C6C1 535 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCN2P20062 427 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA4P22748 312 aa13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT2Q10471 571 aa13.03□□□□□ -0.32
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