RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 VWA7Q9Y334 891 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1W2PP55 124 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 H0Y858 1186 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PSMD11O00231 422 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 AREL1O15033 823 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 OR1I1O60431 355 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 GLRA3O75311 464 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 DNTTP04053 509 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CRABP2P29373 138 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CRHR1P34998 444 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 DRD3P35462 400 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 GMPRP36959 345 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 IRF9Q00978 393 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZP2Q05996 745 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ITGA9Q13797 1035 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CCINQ13939 588 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 DBN1Q16643 649 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 GPR33Q49SQ1 333 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 EOGTQ5NDL2 527 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 SCAMP4Q969E2 229 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 OLFM1Q99784 485 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 BPTFQ12830 3046 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1W2PQF6 199 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 MMP20O60882 483 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ACRV1P26436 265 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CA5AP35218 305 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PTGER3P43115 390 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 WNT9AO14904 365 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 RHOBTB1O94844 696 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CDKN2DP55273 166 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 DCDC1P59894 354 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF284Q2VY69 593 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 NXPE1Q8N323 547 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ACOT9Q9Y305 439 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PLLPQ9Y342 182 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 A6NNZ2 444 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PCDH8O95206 1070 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 C6P13671 934 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 IL9RQ01113 521 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 AGBL4Q5VU57 503 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 RBFAQ8N0V3 343 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC63Q8NA47 563 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CENPTQ96BT3 561 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 FAM136AQ96C01 138 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ULK4Q96C45 1275 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 AP2M1Q96CW1 435 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CLPBQ9H078 707 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 CDH19Q9H159 772 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 ABCG8Q9H221 673 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 THEGQ9P2T0 379 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 A0A087X1B8 175 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC6O75061 913 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 FDXRP22570 491 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 IRX4P78413 519 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PRKCQQ04759 706 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 C16orf46Q6P387 395 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 PIM3Q86V86 326 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-204ENST00000402096 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms