RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 HSPB3Q12988 150 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ESAMQ96AP7 390 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 DUSP16Q9BY84 665 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TRBC1P01850 177 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CCL5P13501 91 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF611Q8N823 705 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ITCHQ96J02 903 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ANPEPP15144 967 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 KCNA5P22460 613 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 UNC93AQ86WB7 457 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 AZIN2Q96A70 460 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 COPS8Q99627 209 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TTPALQ9BTX7 342 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 A0A087WXM4 84 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PRODHO43272 600 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RLN1P04808 185 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PBX3P40426 434 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 GTF2BQ00403 316 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TRPV3Q8NET8 790 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 HERVK_113Q902F9 699 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 UBE2E3Q969T4 207 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RIPK3Q9Y572 518 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC7A2P52569 658 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NAB1Q13506 487 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZBTB6Q15916 424 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RNF121Q9H920 327 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 A0A0G2JN53 185 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 STX16O14662 325 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MFSD11O43934 449 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MMP3P08254 477 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TRIM63Q969Q1 353 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ULK3Q6PHR2 472 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 DIP2BQ9P265 1576 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SH3D21A4FU49 640 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MATKP42679 507 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NOMO3P69849 1222 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 C2orf80Q0P641 193 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NDUFA5Q16718 116 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 STARP49675 285 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PUDPQ08623 228 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 IL18R1Q13478 541 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PRELID2Q8N945 189 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NXNL1Q96CM4 212 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ABI3Q9P2A4 366 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 A0A0J9YYE9 177 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CD48P09326 243 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CYP2C18P33260 490 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CD101Q93033 1021 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FPGTO14772 594 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SUV39H1O43463 412 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 UGT2B17O75795 530 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ITGB5P18084 799 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MTHFRP42898 656 aa14.65□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FOLH1Q04609 750 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms