RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358543.8

ALKAL1-201, Transcript of ALK and LTK ligand 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALKAL1, Length 1,217 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1-201ENST00000358543 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CCDC38Q502W7 563 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 FAM151BQ6UXP7 276 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 DBX2Q6ZNG2 339 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CEP112Q8N8E3 955 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 BBOF1Q8ND07 529 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 GLYATL1Q969I3 302 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TBATAQ96M53 351 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SMOXQ9NWM0 555 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 KLQ9UEF7 1012 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 KLF15Q9UIH9 416 aa24.11■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 MAGEB16A2A368 324 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SDR42E2A6NKP2 422 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 AGAP14A8MT82 685 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ESPNB1AK53 854 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 H3BM21 787 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 INPP4BO15327 924 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 AVILO75366 819 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SRP72O76094 671 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CEACAM5P06731 702 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 MGAT1P26572 445 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SRP54P61011 504 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TMPRSS15P98073 1019 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ACVR1Q04771 509 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 PEX6Q13608 980 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ALG11Q2TAA5 492 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF398Q8TD17 642 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 KIFC1Q9BW19 673 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 MYLKQ15746 1914 aa24.1■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 RASGRP1O95267 797 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 PRAMEF1O95521 474 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 JUNDP17535 347 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 HK3P52790 923 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF542PQ5EBM4 170 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 DUPD1Q68J44 220 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 OR13J1Q8NGT2 312 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SAP25Q8TEE9 199 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 RAB17Q9H0T7 212 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TRIM39Q9HCM9 518 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 FGF22Q9HCT0 170 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SYBUQ9NX95 663 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 WHRNQ9P202 907 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 VPS18Q9P253 973 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SNX24Q9Y343 169 aa24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TP73O15350 636 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 TNFP01375 233 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ITGA8P53708 1063 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 CRADDP78560 199 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 NFATC2Q13469 925 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 GPR33Q49SQ1 333 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SNX20Q7Z614 316 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SGSM3Q96HU1 749 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF778Q96MU6 729 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SLC13A1Q9BZW2 595 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ASB8Q9H765 288 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 SOX13Q9UN79 622 aa24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ALKAL1-201ENST00000358543 PRSS38A1L453 326 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 GPR89AB7ZAQ6 455 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 UGT1A9O60656 530 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 PIAS2O75928 621 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 IVLP07476 585 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 GPR89BP0CG08 455 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 UGT1A6P19224 532 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 UGT1A1P22309 533 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 UGT1A4P22310 534 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 MC4RP32245 332 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 UGT1A3P35503 534 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 UGT1A5P35504 534 aa24.07■■□□□ 1.44
ALKAL1-201ENST00000358543 DRG2P55039 364 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms