RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341403.9

UBXN8-202, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-202ENST00000341403 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PIK3R3Q92569 461 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 WNT8BQ93098 351 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MARVELD3Q96A59 401 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 FBXL8Q96CD0 374 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TMCO6Q96DC7 493 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NPY6RQ99463 290 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CHID1Q9BWS9 393 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RACGAP1Q9H0H5 632 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TREX1Q9NSU2 369 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MAP10Q9P2G4 905 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RLFQ13129 1914 aa9.5□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 LACTBL1A8MY62 500 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 G3V2T6 193 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SLC1A7O00341 560 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NR5A2O00482 541 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PRKD3O94806 890 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ALX3O95076 343 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PGK1P00558 417 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CD4P01730 458 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 AHSGP02765 367 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 EDN1P05305 212 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NFICP08651 508 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CXCL8P10145 99 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PCNAP12004 261 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CHRM3P20309 590 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CD9P21926 228 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PCMT1P22061 227 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 S100A5P33763 92 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NUDT1P36639 197 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 GRM5P41594 1212 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SULT1E1P49888 294 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SUOXP51687 545 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TPTEP56180 551 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 GNG2P59768 71 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TPI1P60174 286 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 C1QTNF8P60827 252 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CRADDP78560 199 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PPP2R2BQ00005 443 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 LIPEQ05469 1076 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ORC1Q13415 861 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 DCAF15Q66K64 600 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 JADE1Q6IE81 842 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 USP43Q70EL4 1123 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ITFG1Q8TB96 612 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 AGR3Q8TD06 166 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NXNL1Q96CM4 212 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RMDN1Q96DB5 314 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 YIPF6Q96EC8 236 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NGLY1Q96IV0 654 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MUS81Q96NY9 551 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 GMLQ99445 158 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SLC30A3Q99726 388 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NACA2Q9H009 215 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 DSN1Q9H410 356 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 DUSP21Q9H596 190 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 AIG1Q9NVV5 245 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CMTM6Q9NX76 183 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 DPP3Q9NY33 737 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SNTG2Q9NY99 539 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF221Q9UK13 617 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms