RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 NDC80O14777 642 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 GPR39O43194 453 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 GDF9O60383 454 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 DUPD1Q68J44 220 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 OXR1Q8N573 874 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MOSPD1Q9UJG1 213 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SMAPO00193 183 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A9O60656 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A6P19224 532 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A1P22309 533 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A4P22310 534 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MC4RP32245 332 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A3P35503 534 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A5P35504 534 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 IL9RQ01113 521 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PEX6Q13608 980 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ITGA9Q13797 1035 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 GDAP1Q8TB36 358 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF398Q8TD17 642 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 GLYATL1Q969I3 302 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TBATAQ96M53 351 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ASB8Q9H765 288 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 WHRNQ9P202 907 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 KLQ9UEF7 1012 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ASMTLO95671 621 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEA3P43357 314 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ARSDP51689 593 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 XIAPP98170 497 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PPARDQ03181 441 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 COX14Q96I36 57 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PWWP2AQ96N64 755 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 FGF22Q9HCT0 170 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SOX13Q9UN79 622 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 DFNA5O60443 496 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ITGALP20701 1170 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 NMBRP28336 390 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 POLD2P49005 469 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SRP54P61011 504 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CES3Q6UWW8 571 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 HID1Q8IV36 788 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 HDAC10Q969S8 669 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PDXPQ96GD0 296 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 VPS35Q96QK1 796 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 KIFC1Q9BW19 673 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 KLF15Q9UIH9 416 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GTQ1 180 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 C4orf47A7E2U8 309 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 H7C0S8 307 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SCAMP1O15126 338 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TP73O15350 636 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SDC3O75056 442 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CSF2P04141 144 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CEACAM5P06731 702 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 JUNDP17535 347 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CCT8P50990 548 aa22.15■■□□□ 1.14
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