RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PSMD8P48556 350 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 MED22Q15528 200 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 MAPK14Q16539 360 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 FAM124AQ86V42 546 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 UBR7Q8N806 425 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CACNA1HO95180 2353 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 E9PCH4 1651 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 AREL1O15033 823 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 AP1S1P61966 158 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 DNAJC18Q9H819 358 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 LAG3P18627 525 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ENPEPQ07075 957 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PPP3CAQ08209 521 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 GXYLT1Q4G148 440 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 RAB43Q86YS6 212 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ANKFN1Q8N957 763 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 NFATC1O95644 943 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 HSD17B2P37059 387 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 FAM189A2Q15884 450 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 GDF3Q9NR23 364 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ADAMDEC1O15204 470 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 NWD1Q149M9 1564 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 BLKP51451 505 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ERVK-21P61565 698 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ANO7Q6IWH7 933 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 FEM1CQ96JP0 617 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 NDNQ99608 321 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 RRAGCQ9HB90 399 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 LIASO43766 372 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 GSTT1P30711 240 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 GLS2Q9UI32 602 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 DIP2AQ14689 1571 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CAPN14A8MX76 684 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PLIN3O60664 434 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 UNC5CO95185 931 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 SMCO3A2RU48 225 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CBFA2T3O75081 653 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CYP3A4P08684 503 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 GLRA2P23416 452 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 ADAM8P78325 824 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 MTMR8Q96EF0 704 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 TTPALQ9BTX7 342 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 VWA7Q9Y334 891 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 WASH3PC4AMC7 463 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 TRIM38O00635 465 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 WNT10BO00744 389 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 PDHA2P29803 388 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 SOX10P56693 466 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 CUZD1Q86UP6 607 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-201ENST00000292535 FABP3P05413 133 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms