RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 SLC13A2Q13183 592 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ITCHQ96J02 903 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 DYTNA2CJ06 578 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 AQP12BA6NM10 295 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TAF4O00268 1085 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 FAM20BO75063 409 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 C22orf31O95567 290 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 GSNP06396 782 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 C8BP07358 591 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CLCN5P51795 746 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 AQP12AQ8IXF9 295 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ZNF540Q8NDQ6 660 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SGCDQ92629 289 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ROPN1LQ96C74 230 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 NODALQ96S42 347 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 NOD1Q9Y239 953 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SNX8Q9Y5X2 465 aa15.24■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 KRBA1A5PL33 1030 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 A8MX80 341 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 GABBR2O75899 941 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SOAT2O75908 522 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CCT8P50990 548 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TRIM32Q13049 653 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 DMC1Q14565 340 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 NUMA1Q14980 2115 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 NIPAL1Q6NVV3 410 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 BIRC7Q96CA5 298 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SENP8Q96LD8 212 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 M0QZ92 97 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ENPP3O14638 875 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 GPIP06744 558 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC26A2P50443 739 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 DSC2Q02487 901 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PWP1Q13610 501 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 EID3Q8N140 333 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 BBS2Q9BXC9 721 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SLAMF8Q9P0V8 285 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SNPHO15079 494 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 COQ9O75208 318 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PRKG2Q13237 762 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PSMD5Q16401 504 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TAF12Q16514 161 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SYT16Q17RD7 645 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 OR10A6Q8NH74 314 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CMTM6Q9NX76 183 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 GNPTGQ9UJJ9 305 aa15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 RAD51BO15315 384 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 IDO1P14902 403 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 MYF6P23409 242 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 GRM5P41594 1212 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 RAD51Q06609 339 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 OR8H2Q8N162 312 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ANKFN1Q8N957 763 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SNX19Q92543 992 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TOR3AQ9H497 397 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 HLA-DQB2P05538 268 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 BMP2P12643 396 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PNPLA4P41247 253 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CLCQ05315 142 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TSNQ15631 228 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CLEC14AQ86T13 490 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ACDQ96AP0 544 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 RANBP9Q96S59 729 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms