RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-201	ENST00000262291	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
VMP1-201	ENST00000262291	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		13.52	□□□□□ -0.24
VMP1-201	ENST00000262291	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.52	□□□□□ -0.24
VMP1-201	ENST00000262291	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	HDAC3	O15379	428 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PFDN1	O60925	122 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CD1D	P15813	335 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	FPGS	Q05932	587 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ESAM	Q96AP7	390 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	MYO19	Q96H55	970 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	REV3L	O60673	3130 aa		13.52	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CDC7	O00311	574 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	TBX10	O75333	385 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	HLA-F	P30511	346 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF711	Q9Y462	761 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CLDN7	O95471	211 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PRKAA2	P54646	552 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	SLC7A9	P82251	487 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ACAP2	Q15057	778 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	GATA6	Q92908	595 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13.51	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	GRM6	O15303	877 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ATP6AP2	O75787	350 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PDE5A	O76074	875 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	UGT1A6	P19224	532 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	UGT1A1	P22309	533 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	UGT1A4	P22310	534 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	UGT1A3	P35503	534 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	UGT1A5	P35504	534 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	MOSPD3	O75425	235 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	PGLS	O95336	258 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	RHO	P08100	348 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	RBP1	P09455	135 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	AOC1	P19801	751 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CHRM3	P20309	590 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	BMPR1A	P36894	532 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	CLCN4	P51793	760 aa		13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
VMP1-201	ENST00000262291	KLF10	Q13118	480 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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