RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf72Q96LT7 481 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TBATAQ96M53 351 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ABCG8Q9H221 673 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 EBF2Q9HAK2 575 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TREX1Q9NSU2 369 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RAB21Q9UL25 225 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPC4 97 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 C10orf142B7Z368 130 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RAD51BO15315 384 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GPR39O43194 453 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 VAPBO95292 243 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PRAMEF1O95521 474 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GOT2P00505 430 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TUBBP07437 444 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MAOBP27338 520 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SSTR1P30872 391 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 AKT2P31751 481 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CNR2P34972 360 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PTGER3P43115 390 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GPR1P46091 355 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ARSDP51689 593 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CREB5Q02930 508 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ACVR1Q04771 509 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DPTQ07507 201 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CBLBQ13191 982 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PEX6Q13608 980 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CHRNA6Q15825 494 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KYNUQ16719 465 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LONRF1Q17RB8 773 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 STEAP4Q687X5 459 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PMS2CLQ68D20 193 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PELI3Q8N2H9 469 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ASB12Q8WXK4 309 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PEX13Q92968 403 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CENPTQ96BT3 561 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SERAC1Q96JX3 654 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 AGAP2Q99490 1192 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CDH19Q9H159 772 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 IL26Q9NPH9 171 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 APPL1Q9UKG1 709 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DMTF1Q9Y222 760 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.47□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-211ENST00000626236 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-211ENST00000626236 H7C0S8 307 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-211ENST00000626236 K7ESM1 405 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-211ENST00000626236 FPGTO14772 594 aa8.46□□□□□ -1.06
SGMS1-211ENST00000626236 INPP4BO15327 924 aa8.46□□□□□ -1.06
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