RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	DKK3	Q9UBP4	350 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SARDH	Q9UL12	918 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916		A0A1W2PQ67	120 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SHISA7	A6NL88	538 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	C2orf81	A6NN90	581 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916		K7EQS6	105 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	LRP3	O75074	770 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SLC4A1	P02730	911 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PML	P29590	882 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GRIA2	P42262	883 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	IL12RB1	P42701	662 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	MAGEA9	P43362	315 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CD151	P48509	253 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GALK1	P51570	392 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ST8SIA6	P61647	398 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PDE1B	Q01064	536 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	DMWD	Q09019	674 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	LRRC14	Q15048	493 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PCM1	Q15154	2024 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	UGP2	Q16851	508 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CLEC14A	Q86T13	490 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CEP97	Q8IW35	865 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CNPY4	Q8N129	248 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	MGARP	Q8TDB4	240 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ARRDC3	Q96B67	414 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	FOXQ1	Q9C009	403 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SNX15	Q9NRS6	342 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	IL36A	Q9UHA7	158 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	EMCN	Q9ULC0	261 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PLLP	Q9Y342	182 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	EML5	Q05BV3	1969 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916		A6NNZ2	444 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	AGAP14	A8MT82	685 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916		A8MX80	341 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	COPE	O14579	308 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TM9SF1	O15321	606 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GPR39	O43194	453 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SPINT1	O43278	529 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	LAMTOR5	O43504	91 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZWINT	O95229	277 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	APOD	P05090	189 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	C2	P06681	752 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	C1S	P09871	688 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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