RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 CPT1BQ92523 772 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LPGAT1Q92604 370 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LPPQ93052 612 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 NXNL1Q96CM4 212 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CSPG4P5Q96PW8 444 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 DPPA5A6NC42 116 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LYNP07948 512 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CREMQ03060 361 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 HGSNATQ68CP4 663 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 DSN1Q9H410 356 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GSAPA4D1B5 854 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TBC1D3BA6NDS4 549 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FPGTO14772 594 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 IFNGP01579 166 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TRBC1P01850 177 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 THRBP10828 461 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 HDCP19113 662 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SDC2P34741 201 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 THOP1P52888 689 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 MAP10Q9P2G4 905 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FZD1Q9UP38 647 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ARHGEF33A8MVX0 844 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FAM25EA8MYX2 175 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CSH1P0DML2 217 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CSH2P0DML3 217 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RPS6KA3P51812 740 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 MANFP55145 182 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LIN52Q52LA3 116 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 OAFQ86UD1 273 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 IL31RAQ8NI17 732 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 HELQQ8TDG4 1101 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 MYO19Q96H55 970 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GBA3Q9H227 469 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 IRAK3Q9Y616 596 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 JAM2P57087 298 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 BCL9O00512 1426 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 WNT7AO00755 349 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CHST10O43529 356 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 MFSD11O43934 449 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CXCR3P49682 368 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 HSF2Q03933 536 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 VGLL4Q14135 290 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 ZFP69Q49AA0 526 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 OLFML2AQ68BL7 652 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 KLHL5Q96PQ7 755 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 DISP2A7MBM2 1401 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CARNS1A5YM72 827 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 NOL4O94818 638 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 DHFRP00374 187 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 AMD1P17707 334 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 MMP8P22894 467 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TEX44Q53QW1 395 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CYP4X1Q8N118 509 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 H0Y858 1186 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CCNKO75909 580 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CDKN2BP42772 138 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-220ENST00000611415 TRPV3Q8NET8 790 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms