RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA3AQ14563 771 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBB8Q3ZCM7 444 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CNSTQ6PJW8 725 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM151BQ6UXP7 276 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 BANPQ8N9N5 519 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ASB8Q9H765 288 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CD248Q9HCU0 757 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD5Q9NXV2 234 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM120BA0PK00 339 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM47DPA6NHR8 397 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 MID1O15344 667 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TYROBPO43914 113 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 MPOP05164 745 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ADARP55265 1226 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.53
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CAPNS1-206ENST00000588815 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1211LQ6NV74 962 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2U1Q7Z449 544 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC91Q7Z6B0 441 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF398Q8TD17 642 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ULK4Q96C45 1275 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 APOPT1Q96IL0 206 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK9Q9NPC2 374 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX15Q9NRS6 342 aa30.89■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 BPTFQ12830 3046 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TPP1O14773 563 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SPINT1O43278 529 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 DNTTP04053 509 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGER3P43115 390 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CREB5Q02930 508 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM45BPQ6NSW5 357 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM45AQ8TCE6 357 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM131CQ96AQ9 280 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN17Q96FV3 270 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM83DQ9H4H8 585 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 FADS3Q9Y5Q0 445 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 COMMD10Q9Y6G5 202 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN6O43657 245 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CCT5P48643 541 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 STARD6P59095 220 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF789Q5FWF6 425 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R42Q7RTR8 314 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 LCA5Q86VQ0 697 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS6Q8IU80 811 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 PIANPQ8IYJ0 282 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 UBALD2Q8IYN6 164 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 AADATQ8N5Z0 425 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 LPGAT1Q92604 370 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 NELL2Q99435 816 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC39A10Q9ULF5 831 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 NEMP1O14524 444 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 COPEO14579 308 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TM9SF1O15321 606 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZWINTO95229 277 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 LIG3P49916 1009 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CSRP3P50461 194 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC12A2P55011 1212 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 USP10Q14694 798 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNA6Q15825 494 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 AGBL4Q5VU57 503 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF765Q7L2R6 523 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 COQ10AQ96MF6 247 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
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CAPNS1-206ENST00000588815 CA14Q9ULX7 337 aa30.86■■■□□ 2.53
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CAPNS1-206ENST00000588815 WNT9AO14904 365 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNB1P11230 501 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 STMN1P16949 149 aa30.85■■■□□ 2.53
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CAPNS1-206ENST00000588815 CRABP2P29373 138 aa30.85■■■□□ 2.53
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CAPNS1-206ENST00000588815 GPATCH11Q8N954 259 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf40AQ8TE69 158 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ELMO2Q96JJ3 720 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 OMDQ99983 421 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC68Q9H2F9 335 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SMOXQ9NWM0 555 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CD72P21854 359 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ACRV1P26436 265 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCG1P45844 678 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB10P61026 200 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ITIH4Q14624 930 aa30.84■■■□□ 2.53
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