RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSL4O60488 711 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ENO1P06733 434 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PGM1P36871 562 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CD86P42081 329 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC11A2P49281 568 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A9P82251 487 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF470Q6ECI4 717 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 MAVSQ7Z434 540 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 MIB1Q86YT6 1006 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CPA6Q8N4T0 437 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR78Q96P69 363 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G4CQ9UP65 541 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TM7SF2O76062 418 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 EGFP01133 1207 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TPBGLP0DKB5 382 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 GNAZP19086 355 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ARRB2P32121 409 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CNR2P34972 360 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH4P55283 916 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 SEPT6Q14141 434 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 E2F5Q15329 346 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP157Q5JU67 520 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ERMP1Q7Z2K6 904 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 DENND6AQ8IWF6 608 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR150Q8NGU9 434 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RY13Q9BPV8 354 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC28BQ9BUN5 200 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PDFQ9HBH1 243 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 HDAC3O15379 428 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TBX18O95935 607 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 PENKP01210 267 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1E1P30953 314 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP8P85298 464 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 MPP1Q00013 466 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXK2Q01167 660 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ACVR1CQ8NER5 493 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 MCM8Q9UJA3 840 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 LEFTY2O00292 366 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 MATN2O00339 956 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 RBP1P09455 135 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 SBK3P0C264 359 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 DRD1P21728 446 aa25.39■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 ITKQ08881 620 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 CTBP1Q13363 440 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM83EQ2M2I3 478 aa25.39■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 CHST9Q7L1S5 443 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.39■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD4Q8WVF5 259 aa25.39■■□□□ 1.66
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CAPNS1-204ENST00000587718 SCYL1Q96KG9 808 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 DLL3Q9NYJ7 618 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 L3MBTL1Q9Y468 752 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA8TH3BQL2 631 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CHRNA4P43681 627 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R39P59534 338 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 DSC2Q02487 901 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF235Q14590 738 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 NAPRTQ6XQN6 538 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR5BQ86VZ2 330 aa25.39■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 COG4Q9H9E3 785 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 POPDC3Q9HBV1 291 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 STOML1Q9UBI4 398 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 SEPT3Q9UH03 358 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN11O75508 207 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CIB2O75838 187 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 GM2AP17900 193 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMA3P25788 255 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ETFBP38117 255 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 GRIA4P48058 902 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 PCSK7Q16549 785 aa25.38■■□□□ 1.65
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