RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	NRDC	O43847	1150 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CAPNS1	P04632	268 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	MYF5	P13349	255 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	JUP	P14923	745 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	HLA-DPA1	P20036	260 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	HMGCL	P35914	325 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GEM	P55040	296 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SLC1A5	Q15758	541 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	NAT6	Q93015	286 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SPATA13	Q96N96	652 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	HACD3	Q9P035	362 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	KCNN4	O15554	427 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	OPA1	O60313	960 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PIRT	P0C851	137 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	HES3	Q5TGS1	186 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	RANBP10	Q6VN20	620 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ARL10	Q8N8L6	244 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GPR26	Q8NDV2	337 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CARD9	Q9H257	536 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	VPS18	Q9P253	973 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CPED1	A4D0V7	1026 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	AURKA	O14965	403 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FGF1	P05230	155 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ADRA1A	P35348	466 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	POLD2	P49005	469 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PEX6	Q13608	980 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PRPSAP1	Q14558	356 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PYCR3	Q53H96	274 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	NRROS	Q86YC3	692 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	IPMK	Q8NFU5	416 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	RMI1	Q9H9A7	625 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	NOBOX	O60393	691 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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