RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559		F5H5T6	163 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MUSK	O15146	869 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP10	O43572	662 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CRCP	O75575	148 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	H6PD	O95479	791 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	HMBS	P08397	361 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TACR2	P21452	398 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	IL10	P22301	178 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ANKS6	Q68DC2	871 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	HIC2	Q96JB3	615 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MPP4	Q96JB8	637 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA17	Q96L03	361 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TRIB3	Q96RU7	358 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CIB1	Q99828	191 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MGME1	Q9BQP7	344 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MUC13	Q9H3R2	512 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF839	A8K0R7	811 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559		H3BMM5	538 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NME4	O00746	187 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PFDN6	O15212	129 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SUPT3H	O75486	399 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	HGF	P14210	728 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MYLK3	Q32MK0	819 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	EML3	Q32P44	896 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OGFOD2	Q6N063	350 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		18.34	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SOAT2	O75908	522 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PYGL	P06737	847 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FAM189B	P81408	668 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GRB7	Q14451	532 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRCAP	Q14761	206 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf22	Q49AR2	442 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LCN8	Q6JVE9	175 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GPR152	Q8TDT2	470 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	18.33	■□□□□ 0.52	3e-13	■■■■■ 37.6
RRN3-205	ENST00000563559	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf4	Q9NR00	106 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	POLG2	Q9UHN1	485 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TMCO1	Q9UM00	188 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		18.33	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS12	A0PJE2	317 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PPP6C	O00743	305 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	STX16	O14662	325 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFS3	O75489	264 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TIPRL	O75663	272 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GJB3	O75712	270 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CHEK2	O96017	543 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF23	P17027	643 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN3	P20807	821 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1B2	P21281	511 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FGFR3	P22607	806 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CTGF	P29279	349 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FOXA1	P55317	472 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FCGRT	P55899	365 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCB1	Q12824	385 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GPR162	Q16538	588 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC58	Q96CX6	371 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PSKH2	Q96QS6	385 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52

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