RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554534.5

PCNX4-208, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-208ENST00000554534 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CLDN7O95471 211 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PEX11BO96011 259 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CALB1P05937 261 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ACP5P13686 325 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MIPP30301 263 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 GPR3P46089 330 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CSNK1DP48730 415 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SUOXP51687 545 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PTSQ03393 145 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 IL10RBQ08334 325 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MMRN1Q13201 1228 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF235Q14590 738 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NR1D2Q14995 579 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NADK2Q4G0N4 442 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PYCR3Q53H96 274 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 LRRC66Q68CR7 880 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 RFX8Q6ZV50 586 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF677Q86XU0 584 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 C3orf20Q8ND61 904 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 BTBD6Q96KE9 485 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TGM7Q96PF1 710 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 OR2M4Q96R27 311 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 DDA1Q9BW61 102 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 FANCLQ9NW38 375 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MAP10Q9P2G4 905 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CROTQ9UKG9 612 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CHKBQ9Y259 395 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CREBBPQ92793 2442 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PIPSLA2A3N6 862 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CFAP69A5D8W1 941 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ANKRD62A6NC57 917 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TTLL8A6PVC2 850 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 B4E171 279 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 KIAA0754O94854 1291 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 AGFG2O95081 481 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TIAF1O95411 115 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SLC4A1P02730 911 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 NTRK1P04629 796 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 IVLP07476 585 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PIRTP0C851 137 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SKILP12757 684 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 IL1R2P27930 398 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TSPAN7P41732 249 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CCL11P51671 97 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PPP1CAP62136 330 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 DSC2Q02487 901 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 HHEXQ03014 270 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 KLRB1Q12918 225 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 MAMLD1Q13495 774 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 KCNAB1Q14722 419 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 GRM3Q14832 879 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ALS2CLQ60I27 953 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CPZQ66K79 652 aa6.64□□□□□ -1.35
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