RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		18.85	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A087X0T9	212 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	STMND1	H3BQB6	276 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	MATN3	O15232	486 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	MFSD11	O43934	449 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CLDN7	O95471	211 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	SERPING1	P05155	500 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM228B	P0C875	321 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	GALNT2	Q10471	571 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	IQCB1	Q15051	598 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	NLRP8	Q86W28	1048 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	KCTD6	Q8NC69	237 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PMEPA1	Q969W9	287 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC38A3	Q99624	504 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ZMYND15	Q9H091	742 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		18.84	■□□□□ 0.61
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF30	P17039	623 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CES1	P23141	567 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ARSE	P51690	589 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	STC1	P52823	247 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	NFKB2	Q00653	900 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SQSTM1	Q13501	440 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	DPYSL3	Q14195	570 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM71B	Q8TC56	605 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	MAML1	Q92585	1016 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ART4	Q93070	314 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	NKD1	Q969G9	470 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CLMP	Q9H6B4	373 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		18.83	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446		A0A1W2PQJ5	194 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446		A8MU76	341 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	WISP1	O95388	367 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	EML2	O95834	649 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PYGL	P06737	847 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CCNC	P24863	283 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CSF2RB	P32927	897 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ARSD	P51689	593 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FANCC	Q00597	558 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM129C	Q86XR2	697 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	COX14	Q96I36	57 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		18.82	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	EFCAB7	A8K855	629 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PRL	P01236	227 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	THRA	P10827	490 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SFTPC	P11686	197 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ITGB6	P18564	788 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ATP1A2	P50993	1020 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	UBASH3A	P57075	661 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	GPLD1	P80108	840 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ZBED6	P86452	979 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	LRP8	Q14114	963 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SFRP1	Q8N474	314 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CCNY	Q8ND76	341 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	OR10G6	Q8NH81	332 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TSGA13	Q96PP4	275 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TRIM4	Q9C037	500 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	STARD5	Q9NSY2	213 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		18.81	■□□□□ 0.6

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