RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 RECKO95980 971 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ERCC2P18074 760 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 VIPR1P32241 457 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 GPR3P46089 330 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 GNPDA1P46926 289 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 LIMK2P53671 638 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 B4GALNT1Q00973 533 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 MAP7Q14244 749 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 NR1D2Q14995 579 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 RFX8Q6ZV50 586 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 LZTR1Q8N653 840 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ZNF599Q96NL3 588 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ZWILCHQ9H900 591 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 RDH14Q9HBH5 336 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 FANCLQ9NW38 375 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 TLK1Q9UKI8 766 aa8.45□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 POLEQ07864 2286 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 H3BRJ5 948 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 EPHB6O15197 1021 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 INPP4BO15327 924 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 B4GAT1O43505 415 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ECEL1O95672 775 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CPP00450 1065 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 FGF1P05230 155 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ARL4AP40617 200 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 RGRP47804 291 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 HCAR3P49019 387 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 RALGDSQ12967 914 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 SQSTM1Q13501 440 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 RAET1GQ6H3X3 334 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 C16orf46Q6P387 395 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 HPS6Q86YV9 775 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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TROAP-208ENST00000548817 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 PSKH2Q96QS6 385 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 LGR4Q9BXB1 951 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 SUFUQ9UMX1 484 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 LGALS16A8MUM7 142 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 PSMD11O00231 422 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 SOCS5O75159 536 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 LRCH4O75427 683 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 PDGFAP04085 211 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CEACAM5P06731 702 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 PYGLP06737 847 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 THRAP10827 490 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ADCY8P40145 1251 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ACTR1BP42025 376 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 STAT5AP42229 794 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 GPR1P46091 355 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 PGDP52209 483 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ACTR1AP61163 376 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CTBSQ01459 385 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 MYL5Q02045 173 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ITKQ08881 620 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 MAMLD1Q13495 774 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CNGA3Q16281 694 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CA9Q16790 459 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 KCTD16Q68DU8 428 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 DOK6Q6PKX4 331 aa8.43□□□□□ -1.06
TROAP-208ENST00000548817 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.43□□□□□ -1.06
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