RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 SGK2Q9HBY8 427 aa16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PREBQ9HCU5 417 aa16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 RAB21Q9UL25 225 aa16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PTPN13Q12923 2485 aa16.81■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MROH6A6NGR9 719 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 J3QKU1 62 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PSMD11O00231 422 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 AVILO75366 819 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PRKCGP05129 697 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TUBBP07437 444 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 SYPP08247 313 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PIRTP0C851 137 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 OXTRP30559 389 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ADPRHP54922 357 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PTPRRQ15256 657 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CNGA3Q16281 694 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PCID2Q5JVF3 399 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 NEK5Q6P3R8 708 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 RELL1Q8IUW5 271 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PGBD3Q8N328 593 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 IFT81Q8WYA0 676 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PEX13Q92968 403 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PWWP2AQ96N64 755 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 KIFC1Q9BW19 673 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 GGT7Q9UJ14 662 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ITM2BQ9Y287 266 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.8■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 HEATR9A2RTY3 570 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LDB2O43679 373 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MYBL2P10244 700 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TPH1P17752 444 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ADRA1DP25100 572 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MCM3P25205 808 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MGAT1P26572 445 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MAOBP27338 520 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 HMGCLP35914 325 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 STC1P52823 247 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 VSNL1P62760 191 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LAMB3Q13751 1172 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LIPIQ6XZB0 460 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CENPUQ71F23 418 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TSPAN33Q86UF1 283 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 EID2BQ96D98 161 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 FMO2Q99518 471 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 SYBUQ9NX95 663 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 NFU1Q9UMS0 254 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 SOX13Q9UN79 622 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.79■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MAGEB16A2A368 324 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 AURKAO14965 403 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CRTAMO95727 393 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 GM2AP17900 193 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PDE1BQ01064 536 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ACVR1Q04771 509 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 POU6F1Q14863 301 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 AGERQ15109 404 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LRRC66Q68CR7 880 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 DBX2Q6ZNG2 339 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 RABEPKQ7Z6M1 372 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 MPP5Q8N3R9 675 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 GANCQ8TET4 914 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ASB12Q8WXK4 309 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 COQ10AQ96MF6 247 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms