RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	CDC16	Q13042	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	BECN1	Q14457	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CRYM	Q14894	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	DLG2	Q15700	870 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	APBB2	Q92870	758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ADAM20	O43506	726 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ALPL	P05186	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PON1	P27169	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PRAME	P78395	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PCLAF	Q15004	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	NAB2	Q15742	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400		M0QZ24	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	HS6ST1	O60243	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	KDM4B	O94953	1096 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLDN14	O95500	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	MMP9	P14780	707 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CD58	P19256	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	BDKRB2	P30411	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	STX2	P32856	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC15A1	P46059	708 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	EPS8	Q12929	822 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	KCTD2	Q14681	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	SGCD	Q92629	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	GFI1	Q99684	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTNNA1-222	ENST00000520400	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	CTDSP2	O14595	271 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	MID1	O15344	667 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	OGG1	O15527	345 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	HOXC6	P09630	235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTNNA1-222	ENST00000520400	GPR143	P51810	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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