RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC11A1P49279 550 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 THOP1P52888 689 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PLK1P53350 603 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RABGGTBP53611 331 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CDKN2DP55273 166 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 TUBA4AP68366 448 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SH3BP2P78314 561 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CEACAM7Q14002 265 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PDK3Q15120 406 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 LIN52Q52LA3 116 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MTX3Q5HYI7 312 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 LHX8Q68G74 356 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 NCEH1Q6PIU2 408 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MIB1Q86YT6 1006 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RNF135Q8IUD6 432 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PLPP6Q8IY26 295 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ANKFN1Q8N957 763 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 NCSTNQ92542 709 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 LPGAT1Q92604 370 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PHF21BQ96EK2 531 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 TOX2Q96NM4 488 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ALG9Q9H6U8 611 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RDH14Q9HBH5 336 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CD320Q9NPF0 282 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RNF112Q9ULX5 631 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PLXNA3P51805 1871 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 A0A0J9YYE9 177 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 H3BNC9 293 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RAD51BO15315 384 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 FZD6O60353 706 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 KATNA1O75449 491 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 STC2O76061 302 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PDE5AO76074 875 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 FGF19O95750 216 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 TBX18O95935 607 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CLPTM1O96005 669 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 OTCP00480 354 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PRLP01236 227 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 F11P03951 625 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CYBBP04839 570 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RPS17P08708 135 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 DGKAP23743 735 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 HTR1EP28566 365 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAPK9P45984 424 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PGFP49763 221 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SCNN1BP51168 640 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ARSDP51689 593 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 EPHB3P54753 998 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 NR1H2P55055 460 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 KCNK10P57789 538 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAXP61244 160 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ERVK-8P63133 956 aa7.24□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms