RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.82■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 INPP4BO15327 924 aa16.82■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 TAS2R40P59535 323 aa16.81■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.81■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.81■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.81■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 SLC28A2O43868 658 aa16.8■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.8■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.8■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 FATE1Q969F0 183 aa16.8■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.78■□□□□ 0.28
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HERC3-211ENST00000513325 KRT7P08729 469 aa16.78■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 MX2P20592 715 aa16.78■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 CASP14P31944 242 aa16.78■□□□□ 0.28
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