RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ST3GAL1Q11201 340 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTC27Q6P3X3 843 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 M0R129 80 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC7A4O43246 635 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLK1P53350 603 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP30Q70CQ3 517 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMIM5Q71RC9 77 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SH3GL2Q99962 352 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DNAJC11Q9NVH1 559 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OLFM2O95897 454 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGRP09769 529 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACADVLP49748 655 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CACNB3P54284 484 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC24Q50LG9 513 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNF43Q68DV7 783 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SVOPLQ8N434 492 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C19orf18Q8NEA5 215 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR8K5Q8NH50 307 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OTUD5Q96G74 571 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MARCH7Q9H992 704 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NAGPAQ9UK23 515 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTMR6Q9Y217 621 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AXIN1O15169 862 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFRSF21O75509 655 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LHCGRP22888 699 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HCAR3P49019 387 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARSFP54793 590 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DHCR24Q15392 516 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF276Q8N554 614 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MEIOBQ8N635 442 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EI24O14681 340 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ESR1P03372 595 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HMGCS2P54868 508 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MFSD10Q14728 455 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC1A5Q15758 541 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RBBP7Q16576 425 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TP53I11O14683 189 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PKNOX1P55347 436 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STON2Q8WXE9 905 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AP2M1Q96CW1 435 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIPK3Q9H422 1215 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 L2HGDHQ9H9P8 463 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPR83Q9NYM4 423 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WASF3Q9UPY6 502 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE2QL1A1L167 161 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGF4P08620 206 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYBP10242 640 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EPHB2P29323 1055 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MDH1P40925 334 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRIK2Q13002 908 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTGISQ16647 500 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IL31Q6EBC2 164 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IL12RB2Q99665 862 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM246Q9BRR3 403 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BCO2Q9BYV7 579 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYNNQ9NPC7 610 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A087X0B3 334 aa4.51□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR6A2O95222 327 aa4.51□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IL6P05231 212 aa4.51□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WEE1P30291 646 aa4.51□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ECI1P42126 302 aa4.51□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRIA4P48058 902 aa4.51□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.7 ms